1974 жылы Қарағанды МТУ (Бұрынғы ҚПТИ) соң құрылыс алаңында шебер, прораб, аға прораб, бас инженер қызметтерін атқарды. 1982 жылы Мәскеу қаласындағы инженерлік-құрылыс институтының аспирантурасына түсті, жетекшісі СССР Ғылым Академиясының мүшесі, Соц.Еңбек батыры иегері Цытович Н.А. Техника ғылымдарының кандидаттық диссертациясын қорғап шықты. В 2007 ж. техника ғылымдарының докторы диссертациясын қорғады, екі мамандық бойынша: «Құрылыс технологиясы мен ұйымдастыру» және «Жер асты құрылысы, фундаменттері және негәздері».
Унайбаев Б.Ж. күрделі жерлер жеғдайы бойынша құрылыс маманы. 400-ден аса ғылыми мақалалары жарияланған.Оның 7-уі монография, 17 оқу құралдары, 43 авторлық куәліктер мен патенттер зерттеуге арналған, 4 нормтивті құжат және 3 практикалық нұсқау. 2 кандидаттық диссертация және 10 магистрлік диссертациялар жетекшісі. С.Торайғыров атындағы магистрлік диссертация қорғау кеңесінің мүшесі, Халықаралық (JSSMGE) және Қазақ геотехникалық ассоциация мүшесі, РАЕ корреспондеттік мүшесі, Жапония, Оңтүстік Корея, Египет, Индия, Түркия, Ресей, Украина, Әзербайжан, Өзбекстан, Қазақстан елдеріндегі халықаралық конференциялар мен симпозиумдардың фундамент құрылысы бойынша қатысушысы. «ЖОО үздік оқытушысы» мемлекеттік грантының иегері. Академик Ш.М.Айталиев атындағы медалімен, Екібатұз қаласы әкімінің құрмет грамотасымен марапатталған, Ак.Қ.И.Сәтбаев атындағы инженерлік-техникалық институтының ректоры, профессор.